Научные статьи

	ОДОНТОГЕННЫЕ ИНФЕКЦИИ
	к.м.н. *Зорькин А.А.*, доцент, АГМУ, Барнаул

Воспалительные заболевания челюстно-лицевой области чрезвычайно широко распространены. Они вызываются в большинстве случаев микроорганизмами, входящими в состав обычного биоценоза микробов кожных покровов лица и слизистой оболочки полости рта. Большинство состояний, относящихся к инфекциям в стоматологии, имеют одонтогенную природу. Существенное значение оказывает и качество оказания медицинской помощи при заболеваниях зубов и пародонта.

Некоторые вопросы ПЦР-диагностики вируса папилломы человека

к.б.н. Красовская О.Э., ООО НПФ "Литех"

Вирус папилломы человека (ВПЧ) относится к вирусам, способным инициировать развитие злокачественных процессов. Рак шейки матки (РШМ) имеет длительный период развития. Поэтому скрининговые мероприятия могут быть заведомо эффективными, так как при ранней диагностике возможно эффективное и полное лечение.

	Нутригенетическое тестирование с помощью ПЦР-наборов НПФ "Литех" Панель "Обмен веществ"
	Информационное письмо составлено по материалам, подготовленным заведующим лабораторией молекулярной генетики человека ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА России к.б.н. Генерозовым Эдуардом Викторовичем

Разработка способов индивидуализации фитнес-программ по контролю веса, основанных на данных генетического анализа является очень популярным направлением. Некоторые из таких первых подходов уже запатентованы и начинают применяться на практике. Среди генетических факторов, которые могут повлиять на правильный выбор диеты и интенсивности физических нагрузок, чаще всего анализируют нуклеотидные полиморфизмы генов FABP2, PPARG, ADRB2 и ADRB3. Эти гены, а точнее их генетическая вариабельность, значительно влияют на то, как быстро и эффективно усваиваются питательные вещества, поступающие с пищей, а значит, они могут препятствовать или помогать достижению и поддержке оптимального веса. Эти генетические вариации (полиморфизмы) не являются патогенными мутациями, они достаточно широко распространены, но, располагая информацией об их наличии или отсутствии, можно точнее оценить индивидуальные особенности своего организма.

	ПЦР тест-системы для выявления анаэробных инфекций
	Информационное письмо составлено по материалам, подготовленным сотрудником ООО "Лаборатория Литех" Крюковой Валерией Александровной

Выявление анаэробных микроорганизмов традиционно является серьезной проблемой для клинической практики. Эти микроорганизмы вызывают тяжелые инфекционные процессы в различных органах и тканях, в большинстве случаев несущие затяжной рецидивирующий характер и создающие угрозу для здоровья и жизни пациентов. Анаэробные инфекции имеют преимущественно эндогенное происхождение, трудно распознаются клинически, часто носят полимикробный характер, в том числе в ассоциациях с микроаэрофильными и аэробными микроорганизмами.

Этиологическая диагностика гнойно-септических осложнений в клинической практике

Т.В.Черненко, Г.И.Макаренко, М.В.Стамм*, В.П.Мудров*, В.Н.Нелюбин, ФГБУЗ Клиническая больница № 123 ФМБА России, * НУЗ Центральная клиническая больница № 6 ОАО "РЖД", VII Научно-практическая конференция Современные технологии и методы диагностики различных групп заболеваний, лабораторный анализ

Гнойно-септические осложнения послеоперационных ран, как и прежде, остаются в центре внимания современной хирургии. Несмотря на значительный объем проводимых профилактических мероприятий, роль раневой инфекции в течение послеоперационного периода велика. Происходит и увеличение тяжести гнойно-септических осложнений с тенденцией роста летальных исходов. Определение вида микроорганизма и его устойчивости к антимикробным препаратам позволяют выбрать тактику ведения пациентов и включить эффективный антибиотик в схему лечения каждого конкретного пациента.

Методом ПЦР можно выявить гены, кодирующие устойчивость к антибиотикам. Сочетанное применение ПЦР и бактериологического метода может существенно сократить сроки принятия решения лечащим врачом о назначении того или иного антимикробного препарата.

Бактериологическая и ПЦР диагностика гнойно-септических осложнений в хирургии

Черненко Т.В., Макаренко Г.И., Мудров В.П.*, Нелюбин В.Н. ФГБУЗ Клиническая больница № 123 ФМБА России, * НУЗ Центральная клиническая больница № 6 ОАО "РЖД", VIII Всероссийская научно-практическая конференция «Молекулярная диагностика - 2014»

В повседневной хирургической практике очень важно иметь объективные данные об этиологии гнойных процессов при раневой инфекции. Определение вида микроорганизма, его устойчивости к антимикробным препаратам позволяют выбрать тактику ведения пациентов с данной патологией и включить эффективный антибиотик в индивидуальную схему лечения.
Метод ПЦР позволяет в течение 3-6 часов с момента получения биологического материала выявить гены, кодирующие определенные ферменты и метаболиты микроорганизмов, обуславливающие устойчивость к антибиотикам.

	Реактивность тромбоцитов на фоне двойной антиагрегантной терапии после стентирования коронарных артерий: генетический полиморфизм и клинические варианты
	*E.З. Голухова, М.Н. Рябинина, Н.И. Булаева, М.В. Григорян, М.Ч. Кубова*, журнал Креативная кардиология №2 2013 г.

При оценке эффективности антиагрегантной терапии у больных с ишемической болезнью сердца (ИБС) было вявлено, что у носителей гетерозиготного и гомозиготного варианта полиморфизма CYP2C19*2 средние показатели активности тромбоцитов были выше по сравнению с пациентами с нормальным генотипом. Повышение значений агрегации тромбоцитов у носителей гетерозиготного и гомозиготного варианта полиморфизма CYP2C19*2 увеличивало риск «больших кардиальных событий».

	Возможность использования метода ПЦР для выявления возбудителей заболеваний пародонта
	Обзор

Возможность использования метода ПЦР для выявления возбудителей заболеваний пародонта

Болезни пародонта наряду с кариесом зубов и его осложнениями являются самыми распространенными стоматологическими заболеваниями у населения России, поэтому актуальность ее решения не вызывает сомнения. Многочисленными исследованиями продемонстрировано, что в основе патогенеза заболеваний пародонта лежит сложное взаимодействие факторов иммунологической реактивности человека и пародонтопатогенной микрофлоры. Важнейшим этиологическим фактором в развитии заболеваний пародонта является зубной налет с присутствующими в нем микроорганизмами и продуктами их жизнедеятельности, которые вызывают местное воспаление. Только небольшая часть этих микроорганизмов, такие как Porphyromonas gingivalis, Prevotella intermedia, Fusobacterium species и Treponema denticola рассматриваются в качестве потенциальной причины развития заболеваний пародонта. Считается, что Aggregatibacter actinomycetemcomitans и Porphyromonas gingivalis могут считаться специфическими маркерами развития острого пародонтита. ПЦР-диагностика инфекционных агентов, обуславливающих развитие заболеваний пародонта позволяет быстро идентифицировать патогенов и назначить адекватный курс лечения, а также проводить контроль эффективности лечения.

	ПЦР-диагностика анаэробных инфекций, вызываемых бактериями рода Bacteroides
	Струкова Л.А. (специалист по продукции), Атрошкина М. Е. (научный сотрудник), ООО НПФ "Литех"

В настоящее время отмечается значительное увеличение доли инфекционных заболеваний, в патогенезе которых ведущую роль играют анаэробные бактерии. Подобные инфекции, как правило, полимикробные, при этом анаэробные возбудители встречаются в ассоциации с другими анаэробными или аэробными микроорганизмами.
Выявление анаэробных микроорганизмов традиционно является серьезной проблемой для клинической бактериологической лаборатории. Большинство видов плохо культивируются или не культивируются вообще, кроме того стандартные микробиологические методы длительны по времени и их результаты становятся известны лишь на 3 – 4 день от момента взятия материала.
Ускорить диагностику и облегчить понимание генетических основ патогенности и антибиотикорезистентности анаэробных бактерий, вызывающих тяжелые инфекции человека, возможно путем применения в практике бактериологических лабораторий новых методов на основе анализа генетического материала бактерий, в частности метода полимеразной цепной реакции.

	Выявление устойчивости микроорганизмов к антибиотикам методом ПЦР
	Струкова Л.А. (специалист по продукции), Парфенов И.А. (специалист по продукции), ООО НПФ "Литех"

Сегодня при бактериальных инфекциях наиболее часто назначаются β-лактамные антибиотики, среди которых различают пенициллины (ампициллин, метициллин), цефалоспорины (цефтриаксон, цефиксим) и карбапенемы (имипенем, меропенем). Они имеют долгую историю использования, являются безопасными и эффективными против широкого спектра бактериальных возбудителей инфекций. Однако масштабное и долгосрочное использование противомикробных препаратов этого класса привело к появлению и распространению микроорганизмов, реализующих лекарственную устойчивость за счет продукции различных вариантов β-лактамаз - ферментов, разрушающих β-лактамные антибиотики, либо за счет модификации пенициллин-связывающих белков (ПСБ), являющихся мишенями действия для β-лактамных антибиотиков.
Результаты научных исследований указывают на необходимость определения чувствительности перед назначением антимикробной терапии. Знание бактериальной резистентности к антибиотикам имеет важное значение для успешной борьбы с болезнью.

	БАКТОПОЛ – комплексная панель реагентов для обнаружения бактероидов
	Обзор

Анаэробные инфекции, как правило, полимикробные, и бактероиды можно обнаружить при большинстве таких инфекций с показателем смертности более 19%. Если обнаруженную инфекцию не лечить, смертность при бактериемии, вызванной Bacteroides, может составлять до 50% в зависимости от выявленного вида (В. thetaiotaomicron> B. distasonis> B. fragilis); и пока не ясно, связано ли это с различиями в факторах вирулентности или с антимикробной чувствительностью. Этот уровень смертности может быть существенно снижен за счет своевременной диагностики инфицирования бактероидами и назначения этиотропной антимикробной терапии.

	Генотипирование по CYP2C19 - фармакогенетический подход к персонализации терапии пациентов после стентирования коронарных сосудов
	проф.,д.м.н. Д.А. Сычев, Л.А. Струкова**, И.А. Парфенов***, консул от России в Европейской ассоциации клинических фармакологов (EACPT), *ООО НПФ "Литех"

Генотипирование пациентов по CYP2C19 с помощью наборов «SNP-экспресс-РВ» методом аллель-специфичной ПЦР до назначения стандартной антиагрегантной терапии определяет персонализированную тактику выбора препаратов и может снизить риск тромбоза стентов, особенно у пациентов с высоким риском по данному осложнению.

	Насколько патогенен вирус TTV?
	Струкова Л.А. (специалист по продукции), ООО НПФ "Литех"

Вирус TTV (transfusion transmitted virus, Torque teno virus) был открыт в 1997 в сыворотке крови японского пациента с посттрансфузионным гепатитом неясной этиологии. TTV вызывает долгую, практически пожизненную виремию у большинства людей независимо от возраста, состояния здоровья и других параметров. Инфекция носит персистирующий характер, реплицирующийся вирус присутствует в самых разных участках организма, включая костный мозг, лимфоидную ткань, легкие и печень. От 70% до 90% всей мировой популяции человека являются носителями вируса TTV, и пока что вирус не был с уверенностью ассоциирован с каким-либо заболеванием, похоже обладая замечательной способностью приспосабливаться к своему хозяину.
TTV первоначально считали причиной острого и хронического не-А-не-Е гепатита, гепатит-ассоциированной апластической анемии, острой печеночной недостаточности, цирроза печени, но эти ассоциации были исключены. Патогенность вируса все еще исследуется, его значимость для клинической диагностики однозначно неочевидна, поэтому мы считаем некорректным регистрировать набор для обнаружения вируса и рекомендовать его к продажам в клинические лаборатории.

	Масс-спектрометрия нуклеиновых кислот в молекулярной медицине
	Е. Н. Ильина, В. М. Говорун*' , ФГУ НИИ Физико-химической медицины Росздрава, 119992, Москва, Малая Пироговская, 1а; *Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Москва

В последние десятилетия наметилась устойчивая тенденция к модернизации в сфере медицинской диагностики путем внедрения в практику высокотехнологичных и наукоемких аналитических систем, позволяющих проводить исследования на молекулярном уровне. Ярким примером таких технологий служат масс-спектрометрические методы анализа биомолекул. Настоящий обзор ставит своей целью осветить возможности современного парка масс-спектрометрического оборудования и проиллюстрировать применение масс-спектрометрии нуклеиновых кислот (ДНК, РНК) для решения практических задач, связанных с исследованиями геномной ДНК человека и клинически значимых микроорганизмов бактериальной и вирусной природы.

	Первый опыт применения метода прямого белкового профилирования для идентификации и типирования N. gonorrhoeae
	А. А. Кубанова В. М. Говорун Е. Н. Ильина В. А. Верещагин Н. В. Фриго Т. А. Припутневич

Прямое белковое профилирование с помощью MALDI-TOF масс-спектрометрии - один из методов протеомной характеристики микроорганизмов, рассматривается в качестве альтернативного подхода для быстрой идентификации и внутривидовой классификации патогенных микроорганизмов. Данный подход был впервые использован для исследования популяции N. gonorrhoeae. Нами была отработана простая методика масс-спектрометрического профилирования бактериальных белков, получены профили для 120 клинических и контрольного (АТСС 49226) штаммов N. gonorrhoeae, что позволило продемонстрировать незначительную гетерогенность регистрируемых для гонококка белковых масс-спектров и выделить в исследованной группе штаммов три протеомных типа. Эти предварительные результаты позволили сделать вывод о потенциальной возможности использования прямого белкового профилирования с использованием MALDI-TOF масс-спектрометрии для быстрой идентификации и внутривидовой классификации N. gonorrhoeae. Представленный подход выгодно отличает высокая чувствительность метода, скорость анализа (простая пробоподготовка и высокая скорость измерения), низкая стоимость используемых реактивов и материалов.

	Распределение полиморфизмов генов некоторых компонентов системы гемостаза у больных ишемической болезнью сердца
	*Т.В. Павлова, В.П. Поляков, Д.В. Дупляков, С.М. Хохлунов, В.И. Кириллов, С.А. Шавкунов*, Журнал "Кардиология" №4, 2009

Исследована структура полиморфизмов генов факторов свертывания крови II, V, VII, тромбоцитарного мембранного гликопротеина IIIa (GPIIIa) и фермента метилентетрагидрофолатредуктазы (MTHFR) у пациентов с ишемической болезнью сердца (ИБС). В данной когорте больных наиболее широко распространены полиморфизм PlA1/A2 гена GPIIIa и 677T/Т полиморфизм гена MTHFR. Подчеркнута противоречивость существующих в настоящее время сведений о влиянии генотипа R/Q гена FVII на раннее развитие ИБС и инфаркта миокарда (ИМ), представлены данные об отсутствии протективного влияния аллеля Q на раннее развитие ИМ. Доказано активирующее влияние полиморфизма PlA1/A2 гена GPIIIa и полиморфизма 677T/Т гена MTHFR на морфофункциональное состояние тромбоцитов. В работе были использованы диагностикумы, разработанные ООО НПФ "Литех".

	ДНК-диагностика наследственных заболеваний у детей в РФ
	П.В. Новиков, О.В. Евграфов, Московский НИИ педиатрии и детской хирургии Минздрава РФ, Научный медико-генетический центр РАМН, Москва

Традиционной, но от этого не менее важной проблемой, является недостаточное финансирование ДНК-диагностики. Эта область особенно чувствительна к недостатку финансов, во-первых, потому что значительную долю расходов составляют расходы на материалы, сократить которые принципиально невозможно. Во-вторых, в ДНК-диагностике происходит, вероятно, самое быстрое обновление технологий, что также требует определенных затрат на разработку и освоение новых методов. И, наконец, самой важной является проблема кадров. Вся ДНК-диагностика в России держится на нескольких людях, имеющих необходимый опыт в данной области. Такое состояние, очевидно, крайне неустойчиво, и из-за потери кадров страна может на десятилетия лишиться наиболее перспективной и быстрорастущей составляющей медико-генетической службы.

	Муковисцидоз
	Использованы материалы, подготовленные *Капрановым Н.И. и Делягиным В.М.* НИИ клинической генетики МГНЦ РАМН, НИИ детской гематологии МЗ РФ, Москва

Муковисцидоз
Использованы материалы, подготовленные Капрановым Н.И. и Делягиным В.М. НИИ клинической генетики МГНЦ РАМН, НИИ детской гематологии МЗ РФ, Москва
Первоначальная мутация возникла, вероятней всего, где-то на границе современных Голландии и Германии. Ген обнаруживается по европейским данным с частотой 1:1500 населения, уступая по распространенности только синдромам трисомии /12/. Постепенно распространяется на восток, где заболеваемость явно нарастает и как результат улучшения диагностики, и как истинный показатель.
Вероятность рождения больного ребенка по европейским данным составляет 1:2000 - 1:2500 живорожденных /13/. Число диагностированных больных в развитых странах равно 7-8 на 100000 населения, из них количество больных старше 18 лет составляет 20%, а в США даже 32% /8/. В России большая часть этих больных не выявляется или выявляется поздно, нередко в запущенной стадии болезни и поэтому распространенность МВ по нашим статистикам не превышает 1:100000 населения, но по расчетам медико-генетического центра РАМН она должна быть 1:12000 новорожденных /4/.
Муковисцидоз является большой медико-социальной проблемой, что обусловлено не только большими моральными, физическими и материальными затратами семьи, органов практического здравоохранения и общества в целом на диагностику, лечение и социальную адаптацию больных, но и достижениями научно-практической медицины, явно увеличившей продолжительность жизни больных.

	Болезнь Вильсона-Коновалова
	Обзор

По классификации наследственных заболеваний болезнь Вильсона-Коновалова относится к нарушениям минерального обмена, а по классификации нервных болезней - к наследственным заболеваниям нервной системы с преимущественным поражением экстрапирамидной системы. При болезни Вильсона-Коновалова нарушаются два основных процесса обмена меди в печени - выведение меди с желчью и биосинтез главного медь-связывающего белка - церулоплазмина. В результате в крови повышается содержание несвязанной меди, что ведет к увеличению концентрации меди в различных органах, преимущественно в головном мозге, почках, печени и роговице, и их токсическому поражению. Заболевание обычно начинается в возрасте от 10 до 25 лет, причем для раннего возраста манифестации (10-16 лет) более характерно проявление заболевания в виде поражения печени, а для более позднего - в виде неврологических нарушений.